问题描述
我正在研究RNAseq数据集。一些来自小鼠的生物之间的重复性非常低，这使得我得出结论，我应该过滤具有高CV的基因。
但是，我现在正在处理来自某种疾病的患者数据集，在该疾病中，定义真正的“组”要复杂得多-它是一个异质群体。
我首先将此数据集计算为小鼠的数据集...但是经过反射，高CV基因实际上可能是真正的生物学变异，而不是技术噪音。
有人对此有任何经验吗？
我当时想过滤所有样本中的低表达基因，但不使用CV作为排除标准。
让我知道您的想法吗？
谢谢， 朱丽叶
解决方法
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