如何在Frangi过滤器中为DICOM数据的3D堆栈设置间距

问题描述

我正在使用 Frangi过滤器进行肝血管分割。 问题在于数据不是各向同性的[1,1,1]。 我可以重新采样。它会创建更多的切片，但会丢失像素，而且不够精确。

我发现，也许可以直接在计算Hessian函数的脚本的Frangi函数（skimage函数）中对其进行更改。但是即使那样，我仍然不知道应该将哪些值设置为 spacing 。

因为我现在有一些结果，但是它们是不正确的，因为我正在使用z方向上的压缩图像进行计算。

谢谢您的帮助。

解决方法

通过阅读代码，当前无法对不同的轴使用不同的比例（sigma）-我们假设每个轴都使用相同的sigma。在将来的版本中应该可以对此进行改进。您可以在https://github.com/scikit-image/scikit-image/issues/new/上创建功能请求。我建议您在创建该问题时链接回该问题。