我想在for循环中使用ggplot2进行多个绘图，但无法识别aes中的Y变量

问题描述

我有一个称为TumorData的数据框，其中的列是不同基因的基因表达数据，行是不同的患者。我想要一个列（名称为TP53）对第3至12列中每个基因的散点图。我做了以下

for(i in 3:12) {
  GeneName <- colnames(TumorData[,i])
  FileName <- paste0(GeneName,".png")
  ggplot(TumorData,aes(x = TP53,y = GeneName)) +
    geom_point()
  ggsave(FileName)
}

但是当我转到保存的文件时，就好像它是一维图：仅相应绘制了第一个参数（TP53）。一切都在同一水平线上，Y轴甚至没有数字刻度。循环确实读取了“ GeneName”，因为实际的基因名称出现在每个图形的Y轴中，但是就像它并不能“理解”它是数据框中的列名称，并且应该检索数字值从那里。我附加了一张图表的外观图像，因为我不确定自己的解释是否足够清楚。 This is how the graph looks

很抱歉，如果这太笨了，我是R的新手，对循环没有太多的经验，更不用说循环和图了。关于如何解决这个问题的任何想法？

编辑：我按照Stefan所说的那样使用了 .data

    for(i in 3:12) {
  GeneName <- colnames(AllPatients[,".png")
  ggplot(AllPatients,y = .data[[GeneName]])) + 
    geom_point()
  ggsave(FileName)
}

成功了，谢谢！

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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for-loop ggplot2 r r