pydicom AttributeError：数据集没有属性'ImagePositionPatient'

编程问答 2022-06-09

问题描述

我是python的新手。我正在尝试导入dicom文件。在许多教程中，以下代码用于使用pydicom导入dicom文件（例如https://www.kaggle.com/gzuidhof/full-preprocessing-tutorial）：

INPUT_FOLDER = '../input/sample_images/'
patients = os.listdir(INPUT_FOLDER)
patients.sort()

将扫描结果加载到给定的文件夹路径中

def load_scan(path):
    slices = [dicom.read_file(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]
    slices.sort(key = lambda x: float(x.ImagePositionPatient[2]))
    try:
        slice_thickness = np.abs(slices[0].ImagePositionPatient[2] - slices[1].ImagePositionPatient[2])
    except:
        slice_thickness = np.abs(slices[0].SliceLocation - slices[1].SliceLocation)
    
    for s in slices:
        s.SliceThickness = slice_thickness
    
    return slices

first_patient = load_scan(INPUT_FOLDER + patients[0])

每次运行此命令时，都会出现以下错误：

AttributeError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-14-883826d71e95> in <module>()
----> 1 first_patient = load_scan(INPUT_FOLDER + patients[0])

2 frames
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/dicom/dataset.py in __getattr__(self,name)
    255         if tag not in self:
    256             raise AttributeError("Dataset does not have attribute "
--> 257                                  "'{0:s}'.".format(name))
    258         else:  # do have that dicom data_element
    259             return self[tag].value

AttributeError: Dataset does not have attribute 'ImagePositionPatient'.

对每个人来说都很明显，但是这段代码导入了单独的dicom文件，这些文件一起构成了CT扫描，并将它们组合成单个数组“切片”。当我将“切片”定义为单个dicom文件而不是尝试将所有切片合并时，我可以编写slices.ImagePositionPatient并返回类似[x，y]的内容，因此原始文件肯定具有此属性。似乎当我将它们全部导入单个数组时，它将以某种方式丢失该属性。据我所知，我是唯一遇到此问题的人。谁能提供任何见识？

解决方法

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attributeerrorpydicom