RPlumber API-以CSV而不是JSON格式返回数据-在Mac上本地工作，但在ubuntu-16.04上不可用

问题描述

我们正在使用RPlumber托管API，我们的开发人员要求API端点以CSV格式而不是JSON格式提供数据。为了解决这个问题，我们需要执行以下操作：

r_endpoints.R

#* @get /test-endpoint-1
testEndpoint <- function(res) {
  mydata <- data.frame(a = c(1,2,3),b = c(3,4,5))
  print('mydata')
  print(mydata)
  con <- textConnection("val","w")
  print(paste0('con: ',con))
  write.csv(x = mydata,con,row.names = FALSE)
  close(con)

  print('res and res.body')
  print(res);  
  res$body <- paste(val,collapse="\n")
  print(res$body)
  return(res)
}

#* @get /test-endpoint-2
testEndpoint2 <- function() {
  mydata <- data.frame(a = c(1,5))
  return(mydata)
}

run_api.r

library(plumber)
pr <- plumber::plumb("r_endpoints.R")
pr$run(host = "0.0.0.0",port = 8004)

test-endpoint-2返回JSON格式的数据，而test-endpoint-1返回CSV格式的数据。当这些端点在Mac上本地运行时，当我命中端点时，会收到以下正确输出：

要托管API，我们已在Linode Ubuntu 16.04服务器上安装了R +库+ pm2，并安装了所有（我认为全部）依赖项。当我们尝试访问服务器上托管的端点时，会收到：

以下是我添加到test-endpoint-1中以帮助调试的打印语句：

[1] "mydata"
  a b
1 1 3
2 2 4
3 3 5
[1] "con: 3"
[1] "res and res.body"
<PlumberResponse>
  Public:
    body: NULL
    clone: function (deep = FALSE) 
    headers: list
    initialize: function (serializer = serializer_json()) 
    removeCookie: function (name,path,http = FALSE,secure = FALSE,same_site = FALSE,serializer: function (val,req,res,errorHandler) 
    setCookie: function (name,value,expiration = FALSE,setHeader: function (name,value) 
    status: 200
    toResponse: function () 
[1] "\"a\",\"b\"\n1,3\n2,4\n3,5"

这些是正确的打印语句-与我们在本地获得的相同。由于某些原因，服务器不允许我们以本地计算机所允许的相同方式以CSV格式返回，而且我不知道为什么会出现这种情况或如何解决。

编辑

在更新本地计算机上的plumber库之后，现在我也在本地计算机上收到错误An exception occurred.。在较新版本的plumber中，似乎我用来将API端点输出转换为CSV文件的代码片段：

  ...
  con <- textConnection("val","w")
  write.csv(x = mydata,row.names = FALSE)
  close(con)

  res$body <- paste(val,collapse="\n")
  return(res)

不再有效。

编辑2

这是我自己的stackoverflow post，这是将近3年前的关于如何以CSV格式返回数据的信息……似乎不再起作用。

编辑3

使用@serialize csv可以“工作”，但是当我点击端点时，数据将以CSV格式下载到我的本地计算机上，而最好以API的CSV格式返回数据，但不会自动下载到CSV文件中...

解决方法

也许可以从中寻找灵感，在这里我将响应内容类型的标题修改为text / plain。文字/纯文字应该显示在我认为的浏览器中。

#* @get /json
#* @serializer unboxedJSON
function() {
  dostuff()
}

#* @get /csv
#* @serializer csv list(type="text/plain; charset=UTF-8")
function() {
  dostuff()
}


dostuff <- function() {
  mtcars
}

,

此丑陋的代码有效

编辑：为swagger UI添加了枚举规范

library(plumber)

#* @get /iris
function(type,res) {
  if (type == "csv") {
    res$serializer <- serializer_csv(type = "text/plain; charset=UTF-8")
  }
  iris
}

#* @plumber
function(pr) {
  pr_set_api_spec(pr,function(spec) {
    spec$paths$`/iris`$get$parameters[[1]]$schema$enum = c("json","csv")
    spec
  })
}

,

An exception occurred 问题实际上来自于 httpuv，并已在最新的 GitHub 版本的软件包中修复（请参阅 https://github.com/rstudio/httpuv/pull/289）。从 GitHub (httpuv) 安装 remotes::install_github("rstudio/httpuv") 并再次运行 API 应该可以解决问题。