带有插入符号包的SVM-RFE

问题描述

我正在尝试使用R上的Command包执行SVM-RFE功能选择:我有一个数据集,其中包含1000列和更多特征(miRNA表达计数,已标准化)作为列(+类,正常与肿瘤)和几百个样本作为行。 我发现caret函数可用于此目的,但是我不确定如何设置参数。 我尤其无法理解rfe参数的含义:仅将某些功能用于模型?当我需要使用RFE选择它们时,这有意义吗? 如果我不设置它会怎样?我不明白这一点。

我尝试先设置sizes,然后再设置rfeControl,但是我不知道这是否是正确的方法

rfe

我设置了参数 method =“ svmLinear” ,因为我发现它确定了所使用的模型,但是我不确定。而且,我不知道在“尺寸”上设置什么。有人可以帮忙吗?我刚开始选择功能,因此,每条建议都将不胜感激。 谢谢。

解决方法

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