问题描述
我正在使用CytoScape软件。它具有自动创建MCL群集的功能，但是我很难看到关联矩阵。有谁知道如何使用Cytospace做到这一点？
mcl cluster generated using clustermaker2
解决方法
用于Cytoscape的clusterMaker2应用程序执行MCL群集，但不提供中间步骤的输出，例如网络的初始矩阵。但是，有一个Cytoscape应用程序可以导出任何给定网络的矩阵版本：http://apps.cytoscape.org/apps/adjexporter。