使用重整形将R中的数据帧从长更改为宽未定义列错误

编程问答 2022-06-07

问题描述

我试图制作一个长表，同时创建唯一的变量以保留粒度细节，即将变量与序列变量var1.seq1 var1.seq2组合

重塑似乎是我的救星，但我不断遇到未定义的列选择错误。

n.b。为了简单起见，我没有将样本数据包含完整的序列号，但是它们最多可以包含180个。

数据示例可在github here

上获得 
Country     Percentage   
US          50      
UK          50
DE          100
AU          100

reshape(df,idvar = "MergeEncounterRecno",timevar = "Sequenceno",direction = "wide") （数据，timevar）中的错误：未定义的列已选中

解决方法

它看起来像是一个错字。试试这个：

#Code
dfres <- reshape(df,idvar = "MergeEncounterRecno",timevar = "SequenceNo",direction = "wide")
,

下面是使用枢轴更长的示例：

是否要旋转列NationalDiagnosis，然后使用第二个透视功能将values转换为字符（而不是数字）。

library(tidyverse)

df <- read_csv("https://raw.githubusercontent.com/Chazzer90/stackoverflowhelp2/main/SEQ_anom.csv")
#> Parsed with column specification:
#> cols(
#>   `<ef>..MergeRecno` = col_double(),#>   MergeEncounterRecno = col_double(),#>   SequenceNo = col_double(),#>   DiagnosticSchemeCode = col_double(),#>   DiagnosisCode = col_double(),#>   DiagnosisSiteCode = col_character(),#>   NationalDiagnosisCode = col_double(),#>   NationalDiagnosis = col_character()
#> )

df %>% 
  mutate(DiagnosisSiteCode = as.integer(ifelse(DiagnosisSiteCode == "NULL",NA,DiagnosisSiteCode))) %>% 
  pivot_longer(cols = DiagnosticSchemeCode:NationalDiagnosisCode,names_to = 'variables',values_to = 'Values',values_drop_na = TRUE,names_ptypes = list(Values = integer()))
#> # A tibble: 134 x 6
#>    `\xef..MergeRec~ MergeEncounterR~ SequenceNo NationalDiagnos~ variables
#>               <dbl>            <dbl>      <dbl> <chr>            <chr>    
#>  1              402           545353          1 Muscle/tendon i~ Diagnost~
#>  2              402           545353          1 Muscle/tendon i~ Diagnosi~
#>  3              402           545353          1 Muscle/tendon i~ Diagnosi~
#>  4              402           545353          1 Muscle/tendon i~ National~
#>  5              758           261891          1 Cardiac conditi~ Diagnost~
#>  6              758           261891          1 Cardiac conditi~ Diagnosi~
#>  7              758           261891          1 Cardiac conditi~ National~
#>  8              894           941852          1 Respiratory con~ Diagnost~
#>  9              894           941852          1 Respiratory con~ Diagnosi~
#> 10              894           941852          1 Respiratory con~ Diagnosi~
#> # ... with 124 more rows,and 1 more variable: Values <dbl>

## do you want to pivot the column NationalDiagnosis
df %>% 
  mutate(DiagnosisSiteCode = as.integer(ifelse(DiagnosisSiteCode == "NULL",DiagnosisSiteCode))) %>% 
  pivot_longer(cols = DiagnosticSchemeCode:NationalDiagnosis,values_transform = list(Values = as.character))

由reprex package（v0.3.0）于2020-10-21创建

rrreshape