关于作物遗传多样性研究的数据库和软件类型的咨询

问题描述

对于一个研究项目,我正在评估罗布斯塔咖啡遗传资源在非洲热带地区的潜力。将对不同的异位遗传系进行定位,并对咖啡豆进行化学,形态和感官分析。

我正在寻找有关如何最好地将遗传图谱和标记与其他类型的数据(例如植物形态和咖啡质量评分)关联的建议。我对生物信息学和基因组数据世界还很陌生。

是否最好将我的遗传图谱/标记与包含有关遗传谱系的所有其他信息的数据集解耦?理想情况下,我希望查找特定的遗传系,并能够查看/提取有关该特定品种的所有信息(表型数据,质量等)。另一方面,我希望能够根据不同的性状对所有遗传系进行分类并进行比较。

https://tropgenedb.cirad.fr/tropgene/JSP/index.jsp似乎是一个很好的例子。

谢谢。

解决方法

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如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

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