IgraphR-从网络内的最短路径边缘创建自我图或等效图

编程问答 2022-06-06

问题描述

我有一个由19个节点和107个边缘组成的网络。它是直接和加权的，并且所有网络都是互连的。

重量不是以公里为单位，而是以“有效距离”（与从一个节点到另一个节点的能源成本非常相似）来衡量的。与C相比，“ ed”越小，前往节点B越容易且可取。

因此，我将此矩阵19x19填充为从每个节点到每个其他连接的节点（很少缺少边）的有效距离。我需要检查网络中最短的路径

# Here i´m extracting all the shortest paths from one node to all the others
asp <- all_shortest_paths(g,mode = c("out"),from = "V(g)")$res

# Here i´m extracting the distances from the same node to all the other,or the total distance 
of every shortest path from above
def <- distances(g,v = "V(g)",algorithm = c("dijkstra"))

我想要的是能够可视化每个节点的自我图，以初始节点为中心位置，并且扩散路径到达网络的其余部分。 到目前为止，我已经尝试过：

  • 将顶点序列转换为边列表并创建一个全新的图形对象
  • 具有weight属性而不是测地距离的make_ego_graph
  • 为主要网络分配子项

由于我在R和Igraph上还很陌生，所以没有一个成功。这个想法是从每个节点的角度研究网络中不同的扩散模式（例如疾病传播，供应链等）

感谢您的帮助， J

解决方法

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