netcdf4-python：读取变量存储参数

问题描述

我正在尝试手动将NetCDF文件的所有尺寸，变量和属性复制到新文件中。与copy netcdf file using python中的方法一样，除了“ fill_value”或“ chunksizes”之类的存储参数外，此方法都有效。在ncdump -sch中，这些参数以下划线（_）开头：

    float var1(time,lat,lon) ;
        var1:_FillValue = NaNf ;
        var1:grid_mapping = "crs" ;
        var1:unit = "m" ;
        var1:_Storage = "chunked" ;
        var1:_ChunkSizes = 1,14,146 ;
        var1:_DeflateLevel = 9 ;
        var1:_Shuffle = "true" ;
        var1:_Endianness = "little" ;

我可以在createVariable中为新变量设置这些参数，但是如何使用netcdf4-python模块从现有文件中获取诸如“ fill_value”或“ chunksizes”之类的参数？读取这些参数的语法是什么？

解决方法

有关块大小的信息，可以对变量使用chunking()方法。不幸的是，如果您将_FillValue设置为非默认值，则只能访问它：

from netCDF4 import Dataset
import numpy as np

nc = Dataset('data.nc','w')
nc.createDimension('t',10)
var = nc.createVariable('temp','f',('t',),fill_value=80)
var[:] = np.arange(10)
nc.close()

nc_read = Dataset('data.nc')
temp = nc_read.variables['temp']
print(temp.chunking())
print(temp._FillValue)

所以现在看来​​，处理填充值的最简单方法是：

fill = getattr(temp,'_FillValue',mydefaultvalue)

也许值得在GitHub上游发布问题。

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谢谢，这就像一个魅力！ 我已经解决了对未定义的_FillValue的处理，例如：

try: fillVal = variable._FillValue
except: fillVal = netCDF4.default_fillvals[str(variable.dtype.kind)+str(variable.dtype.itemsize)]

看起来有点复杂，但是dtype似乎没有针对default_fillvals的预期输入的输出格式方法