如何使用tidyverse工具将矩阵读取到R中？

问题描述

能帮我吗？

我经常需要将发病率矩阵（AxB）读入R格式为 TXT 的文件中。他们看起来像这样：

matrix <- matrix(round(runif(50,100),0),5,10)

我通常的解决方案涉及base的read.delim和as.matrix：

as.matrix(read.delim("matrix.txt",row.names = 1))

文件被读取并转换为matrix类，因此可以进行适当的分析。

但是，我希望也可以使用 tidyverse的 read_delim读取矩阵文件，因此对于大型矩阵或大量矩阵，读取过程可以更快。我已经尝试过了：

as.matrix(read_delim("matrix.txt",delim = "/t"))

但是数据以一种非常奇怪的格式被加扰，并且信息丢失了。是否可以使用 tidyverse 工具阅读和处理关联matrices？

谢谢！

解决方法

在R中，您需要使用反斜杠来表示特殊字符和转义字符。

尝试

as.matrix(read_delim("matrix.txt",delim = "\t"))

read_delim函数没有row.names选项，因此您将必须转换数据以将行名作为行名（而不是第一列）获得。在转换为矩阵之前，应先执行此操作。

library(tidyverse)
matrix <- read_delim("matrix.txt",delim = "\t") %>%
  column_to_rownames(first_column) %>%
  as.matrix()

,

尝试

as.matrix(read_delim("matrix.txt",delim = "\t",col_names = F))