问题描述
我正在尝试对二进制数据进行分层聚类分析，对于距离矩阵，我应用了纯素食包中的函数vegdist()：
dist.jac <- vegdist(final_df,method="jaccard",binary = TRUE)
接下来，我使用了hclust函数，但不确定是否应该使用vegdist()产生的相异矩阵：
jac <- hclust(dist.jac,method = "ward.D")
或尝试这样的操作（如我所见）：
jac <- hclust(dist(dist.jac),method = "ward.D")
因为函数hclust()需要'由dist产生的不相似结构'。但另一方面，素食主义者的包说“应该提供dist的直接替代，并返回相同类型的距离对象”和“该功能是dist的替代品”。申请dist(dist.jac)对我来说没有多大意义，但我看到这样做了，所以如果有人可以向我解释我应该使用哪个人，我将非常感激！
解决方法
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