问题描述
我正在尝试分析微生物群落样本的beta多样性。我有两个因素（物质因素和星期因素），都具有3个水平，并且已经基于bray-curtis差异矩阵构造了NMDS图。现在，我想测试双向通心粉中我的因子和水平及其相互作用之间的统计差异。
到目前为止，我已经在素食主义者（adonis()）软件包中使用了vegan:: adonis2(formula = dist_mat_exW ~ sampledf_exW$week * sampledf_exW$material,permutations = 999函数。对于交互作用和主要效果，我有重要的p值（β分散值也很好），并且希望进行某种成对分析，但是我认为这对他的任何素食函数和{ 1}}函数无法运行，我相信此刻还是存在固有问题。
所以我的问题是进行这种分析的最佳方法是什么？我并不仅限于使用adonis函数，也可以在适当的情况下接受其他方式的测试，但是我对这类多元分析还是陌生的，因此我对不同的分析选项并不了解。
为清楚起见，我要回答的问题是：
- 第一周内，材料类型之间存在显着差异
- 第三周内，材料类型之间存在显着差异
- 第六周内，材料类型之间存在显着差异
AND
- 在材料x中，第1,3周和第6周之间存在显着差异
- 在材料y内，第1,3周和第6周之间存在显着差异
- 在材料z内，第1,3周和第6周之间存在显着差异
任何建议将不胜感激，谢谢！
解决方法
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