除了XML

问题描述

我正在使用SPARQLWrapper查询本地SPARQL端点（使用apache-jena-fuseki），而我的一些查询是CONSTRUCT查询。

查询将为我提供基于Web的SPARQL界面上的有效结果，例如yasgui。使用SPARQLWrapper时，默认查询方法将给我以下错误：

Response:
b'Error 400: Failed to write output in RDF/XML: Only well-formed absolute URIrefs can be included in RDF/XML output: <arcp://uuid,00000000-0000-0000-0000-000000000000/> Code: 28/NOT_DNS_NAME in HOST: The host component did not meet the restrictions on DNS names.\n'

（我已将UUID替换为0。）

我找到了this post。不幸的是，源数据不受我的控制，因此我无法轻松更改其内容-它是CWL-Prov，其standard告诉它使用此表示形式。因此，我需要使用其他返回格式。我在yasgui上尝试了N-Triples和Turtle格式，它们在那里工作。

但是，在SPARQLWrapper上设置返回格式时，会出现问题。如果我将其设置为SPARQLWrapper.XML以外的任何其他值，它将返回此错误（以N3为例）：

Response:
b"Error 400: Can't determine output content type: n3\n"

（CONSTRUCT查询不支持JSON。）

如果我使用给定字符串以外的自定义字符串，它将自动回退到XML（如其文档中所述）。

该错误是由fuseki产生的，所以我相信也许我做错了什么。有没有人遇到这种情况以及如何解决？

我用来执行查询的代码段：

import SPARQLWrapper

sparql = SPARQLWrapper.SPARQLWrapper('http://localhost:3030/prov')
#query = '' # The CONSTRUCT query here
sparql.setQuery(query)
sparql.setReturnFormat(SPARQLWrapper.N3)
return sparql.query().convert()

按照@AndyS的建议，我用Turtle替换了N3，但是仍然出现错误。用-v运行fuseki，这是我得到的：

[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1]   => User-Agent:          sparqlwrapper 1.8.5 (rdflib.github.io/sparqlwrapper)
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1]   => Connection:          close
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1]   => Host:                127.0.0.1:3030
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1]   => Accept-Encoding:     identity
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1]   => Accept:              application/turtle,text/turtle
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     WARN  SPARQL Query: Unrecognize request parameter (ignored): results
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1] Query = 

MY-ORIGINAL-QUERY-OMITTED

[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1]   <= vary:                Accept,Accept-Encoding,Accept-Charset
[2020-11-04 17:02:22] Fuseki     INFO  [1] 400 Can't determine output content type: turtle (165 ms)

我复制了打印的查询，它在YASGUI上有效。关于URI / IRI方案的违反也有一些错误，我在这里省略。

我在查询URL的末尾看到了这些额外的查询参数：

&format=turtle&output=turtle&results=turtle

也许它们与错误有关？但是，为什么funki既不抱怨format和output（如results）也不打印它们（如query）呢？

解决方法

SPARQLWrapper默认为添加

&format=turtle&output=turtle&results=turtle

针对请求。

SPARQLWrapper具有方法setOnlyConneg，该方法可以关闭其他查询字符串部分的添加。

发生WARN SPARQL Query: Unrecognize request parameter (ignored): results的原因是Fuseki确实了解results并记录了有关它的警告。这只是一个警告。
format是一种覆盖适当的HTTP内容协商机制的机制，因为在某些情况下很难设置HTTP标头。这不适用于正确设置Accept:的SPARQLWrapper。
format=turtle不在CONSTRUCT查询的名称列表中。 ttl是。（为了完整起见，可以将turtle添加到Fuseki的未来版本中。）

最好的方法是不要使非标准查询字符串参数带有setOnlyConneg。 SPARQLWrapper在请求中正确设置了“ Accept：”标头，Fuseki进行了内容协商，并将与该标头一起使用。

fuseki sparql sparqlwrapper