如何计算2D样本的MCMC Geweke准则收敛性？

问题描述

所以我正在使用pymc3来为MCMC链计算Geweke和Gelmen-Rubin诊断，例如：

chain = sampler(data,samples=5000,mu_init=9,sigma=sigma,proposal_width=2,mu_prior_mu=mu_prior,mu_prior_sd = sigma_prior)

gw_plot = pm3.geweke(chain)

这在1D模式中很好，但是现在我想在2D模式中做到这一点，但是我的链长5000 x 2，我不确定是否应该输出一个或两个数字？即我是分别进行每个维度还是希望可以得到一个摘要诊断？但是目前，我得到2 x 5000 x 2的形状作为gw_plot，我不确定该怎么做？谢谢

解决方法

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