如何使用emmeans软件包绘制均值和置信区间的差异?

问题描述

我正在运行一个包含2向交互的混合模型。模型看起来像这样

model.1 <- glmmTMB(Weight ~ Treatment*Week + (1|Animal.ID),data=df,family=nbinom1) 

治疗是一个因素,有2个级别(感染和未感染),而一周是一个因素,有9个级别(9周)。

模型的输出表明,治疗与3-7周之间的星期之间存在显着的交互作用。

但是,当我绘制预测的均值和置信区间时,条形图重叠并且该图看起来不太有说服力。

我想知道是否有更好的方法来展示此模型的结果。我最初的想法是使用emmeans软件包绘制均值和置信区间的差异,但我不知道该怎么做。

我尝试使用以下代码(均不正确)计算均值差,但其值与预测的均值相同,并且两个图看起来相同。这是正确的吗?

plot.1 <- emmip(model.1,Treatment~Week,type = "response",CIs = TRUE,plotit = FALSE) 

我想知道如何使用emmeans软件包或其他软件包(如果可能)计算均值和置信区间的差异。

解决方法

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