使用rpy2的控制台输出在Jupyter Notebook中不起作用

问题描述

使用Jupyter Notebook，当我从使用R内核的笔记本的R包（在我的情况下为Climatol）中执行功能时，消息将显示为输出，报告正在执行的过程。没什么新的。

使用的代码块是这样：

library(maps)
library(mapdata)
library(climatol)

# Apply function (from R kernel)
homogen('Vel',2011,2012,tinc='6 hour',expl=TRUE)

现在，使用另一个笔记本上的Python内核，当我通过使用相同参数的rpy2调用相同的函数时，没有得到与上一张图像相同的消息。相反，我得到这个：

这次，使用的代码块是这样：

from rpy2.robjects import r
from rpy2.robjects.packages import importr

importr('maps')
importr('mapdata')
importr('climatol')

# Apply function ( from Python kernel)
r["homogen"]("Vel",tinc="6 hour",expl=r['as.logical']("T"))

我从Sublime Text运行了提到的Python代码，在这种情况下，显示消息：

从Windows控制台运行代码时，也会显示这些消息，这使我认为不利的是Jupyter。话虽这么说，我如何使用Jupyter获得这些消息？

我正在使用Python 3.7，rpy2的版本是2.9.4

感谢您的帮助。

解决方法

rpy2在Windows上不完全支持。用于设置R输出处理方式的回调可能无法正常工作，这会导致您观察到问题。

如果有所改善，将在最新的rpy2版本中提供。例如，最新的rpy2版本是3.3.6。

否则，为了在Windows上获得更好的兼容性，请考虑在Docker中运行rpy2 / jupyter，或者在WSL（Linux的Windows子系统）中运行。