无论如何加载SDF文件并获取诸如mols，inchi和reagent之类的详细信息？

编程问答 2022-06-02

问题描述

我一直在使用 RDKIT 从 SDF 文件加载和获取详细信息，但它不起作用。

    from rdkit import Chem
    from rdkit.Chem.ChemUtils.SDFToCSV import Convert
    from rdkit.Chem import PandasTools
    import pandas as pd
    import os
    from rdkit import RDConfig

    sdfFile = os.path.join(RDConfig.RDDataDir,'C:/Users/mastane_lael/Desktop/Test Scheme.sdf')
 frame=PandasTools.LoadSDF(sdfFile,smilesName='SMILES',molColName='Molecule',includeFingerprints=True)
    frame.info

我得到空白输出。

 <bound method DataFrame.info of Empty DataFrame
 Columns: []
 Index: []>

我也在分享我的 SDF 文件以供参考。

https://drive.google.com/file/d/1kZ2DwsYVpqRPIERyHGAGYT_NhE3ErZtN/view?usp=sharing

我想获取反应物、试剂和摩尔的详细信息以及 sdf 文件中存在的任何信息。

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

如果你已经找到好的解决方法，欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@）

pythonrdkit