TAR 包的 rtools40 Windows 安装问题

编程问答 2022-06-01

问题描述

我最近安装了 Rtools 包，用于下载和解压 TAR 包。我正在使用旧包“TCGA2STAT”中的以下代码，使用“getTCGA()”函数。

brca = getTCGA(disease = "BRCA",data.type = 'RNASeq2',clinical = TRUE,type = 'RPKM')

我收到一个错误

错误：系统中未安装 TAR。数据解压失败。

2018 年有一个类似的问题，有人回答了以下问题

Sys.setenv(TAR ="C:\\Program Files\\rtools40\\usr\\bin\\tar")
Sys.setenv(R_GZIPCMD ="C:\\Program Files\\rtools40\\usr\\bin\\gzip")

在检查它是否有效时我输入了

Sys.which('tar')

和响应

焦油 "C:\WINDOWS\SYstem32\tar.exe"

当 Sys.getenv('tar') 显示时

[1] "C:\Program Files\rtools40\usr\bin\tar.exe"

请帮忙解决这个问题。

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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rrrtoolstar