问题描述
我正在使用 ropls_1.22.0 包来执行具有单个响应和 200 多个预测变量(来自代谢组学)的 OPLS。
opls_model=opls(PredMatrix,ResponseMatrix,predI = 1,orthoI = NA,permI=20,crossvalI=10)
关于正交分量的数量(即函数中的orthoI),文档[link]说“当设置为NA时,执行OPLS并通过使用交叉自动计算正交分量的数量- 验证(最多 9 个正交分量)"
我想知道是否有一种方法可以确定正交分量的最佳数量而不限制为最多 9 个?
我尝试使用 caret 包执行交叉验证,但它不适用于 opls。
谢谢。
解决方法
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