从 R 到 reticulate 使用 python 的 plotnine 创建绘图

问题描述

作为 R 用户，我正在学习通过 reticulate 在 R 中合并 python 命令，我尝试使用 R 中的 plotnine 包绘制图形，但它返回以下错误，有人可以帮忙吗？

library(reticulate)
library(ggplot2)

pd <- import('pandas',as='pd',convert=FALSE)
p9 <- import('plotnine')

mpg_py <- r_to_py(mpg,convert=FALSE)
mpg_pd <- pd$DataFrame(data=mpg_py)

p9$ggplot(data=mpg_pd,p9$aes(x='displ',y='cty'))

# Error in py_call_impl(callable,dots$args,dots$keywords) : 
#   AttributeError: 'nonetype' object has no attribute 'f_locals'

解决方法

this 问题的答案为我指明了解决此错误的有希望的途径。该错误似乎是由处理 plotnine 的命名空间/范围的 patsy 包中的问题引起的。默认情况下，plotnine.ggplot 构造函数会创建一个环境以了解从何处获取绘图数据和美学。因此，根据链接的答案改编，这里有一个潜在的解决方案，我们导入 patsy 包并使用 ggplot 函数中的 environment 参数来传递评估环境 (docs)。

library(reticulate)
library(ggplot2)


pd = import('pandas',convert=F)
p9 = import('plotnine')
# new imports
patsy = import('patsy')
  # import to be able to show in RStudio (see issue here: https://github.com/rstudio/rstudio/issues/4978)
matplotlib = import('matplotlib')
matplotlib$use('tkAgg')
plt = import('matplotlib.pyplot')

mpg_py <- r_to_py(mpg,convert=FALSE)
mpg_pd <- pd$DataFrame(data=mpg_py)

plot_py = p9$ggplot(mpg_pd,p9$aes(x='displ',y='cty'),# new code (-1 was the only value that didn't throw an error)
          environment = patsy$EvalEnvironment$capture(eval_env=as.integer(-1)))
print(class(plot_py)) # "plotnine.ggplot.ggplot" "python.builtin.object"

# Actually show the plot
plot_py
plt$show()

plotnine reticulate