没有掩码的U-Net分割

问题描述

我是深度学习和语义分割的新手。

我有一个 Dicom 格式的医学图像 (CT) 数据集,我需要在其中分割图像中涉及的肿瘤和器官。我已经标记了我们医生绘制的器官轮廓,我们称之为 RT 结构,也以 Dicom 格式存储。

据我所知,人们通常使用“面具”。这是否意味着我需要将 rt 结构中的所有轮廓结构转换为掩码?或者我可以直接使用来自 RT 结构 (.dcm) 的信息作为我的输入?

感谢您的帮助。

解决方法

有一个名为 pydicom 的特殊库,您需要先安装它,然后才能对 X 射线图像进行实际解码和可视化。

现在,由于您想要应用语义分割并且想要分割肿瘤,因此解决方案是创建一个神经网络,该网络接受一对 [image,mask] 作为输入,例如,所有位置面具中除肿瘤所在区域外均为0,标为1;实际上,您的基本事实就是面具。

当然,为此您必须实现您的 CustomDataGenerator(),它必须在每一步产生一批 [image,mask] 对,如上所述。