聚合图中的行

编程问答 2022-05-30

问题描述

我有一个 seuratObject，rownames 是基因名称，在列表中不是唯一的，colnames 是样本 ID。

counts <- GetAssayData(seuratObject,assay="RNA",slot="data")
genes <- c("Dmd")
counts <- as.matrix(counts[rownames(counts) %in% genes,])

# You can then prepare your Metadata using this code.
Metadata <- seuratObject[[]]
Metadata <- Metadata[rownames(Metadata) %in% colnames(counts),] 

# These can then be used as input to ComplexHeatmap.
heatmap(counts,col = c("cornflower blue","green","red"))

热图在这里

enter image description here

我得到的是一个有 n 行的热图（Dmd 基因在列表中重复的次数），我想得到的是所有计数相加的单行。我认为它应该与rowSums有关，但我不知道如何将其应用于情节。有谁知道如何实现这一目标？

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

如果你已经找到好的解决方法，欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@）

rrrowsumseurat