如何在没有任何分隔符的情况下分隔连续的字符串?

问题描述

我的输入数据是一个 VCF(变体调用格式)文件。我感兴趣的每一行看起来像这样:

chrI    22232   DEL00bed        N       <DEL>   .       PASS   SUPP=1159;SUPP_VEC=11111111111111111111111011111111111

我想计算 n 个样本支持的特定位置 (22232) 中特定删除的存在 (1)。出于这个原因,我查看了 SUPP_VEC= 值,但是,我不知道如何将每个值拆分为 1) 它是一个字符串,并且 2) 没有分隔符。如何在每个字符之间添加空格?或者我如何从 SUPP_VEC=python3 拆分/计算值?

我也很想知道 SUPP 是什么意思。我找到了一个SUPP=2,如果 SUPP_VEC 中的存在 (1)\abscence(0) 计算 SUPP 的值,我在 Excel 上查看,但是,我只能计算 1 而不是2,可能有人知道SUPP是什么意思。

我的程序的原因是有一个特定删除类型的频率表。

我希望我说清楚了。 提前致谢。

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!

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