问题描述
我有一个 Rmd 文件,我想将其转换为 pdf 文件。目前它位于“静态”文件夹的子文件夹中,该文件夹是我的博客站点结构的一部分,由 blogdown 包创建。问题是,当我在 RStudio 中点击“Knit”按钮时,它会在我期待 rmarkdown::render_site(...)
时调用 rmarkdown::render(...)
。我确实有一个带有一行命令 R/build.R
的文件 blogdown::build_dir("static")
所以这对我来说很奇怪。当我尝试转换其他文件夹中的其他 Rmd 文件(不与我的博客文件夹/文件相关联)时,一切正常。
为了得到我想要的东西,我目前正在控制台中输入 rmarkdown::render("myfile.Rmd")
,或者我正在使用无限月亮阅读器,但都没有“编织”按钮那么方便:(
以下是将 blogdown 包更新到 1.1 版后 xfun::session_info('blogdown')
的输出:
> xfun::session_info('blogdown')
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 18363),RStudio 1.4.1103
Locale:
LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 LC_MONETARY=English_United States.1252
LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_United States.1252
Package version:
base64enc_0.1.3 BH_1.75.0.0 blogdown_1.1 bookdown_0.21 digest_0.6.27 evaluate_0.14 glue_1.4.2
graphics_4.0.3 Grdevices_4.0.3 highr_0.8 htmltools_0.5.0 httpuv_1.5.4 jsonlite_1.7.2 knitr_1.30
later_1.1.0.1 magrittr_2.0.1 markdown_1.1 methods_4.0.3 mime_0.9 promises_1.1.1 R6_2.5.0
Rcpp_1.0.5 rlang_0.4.9 rmarkdown_2.6 servr_0.21 stats_4.0.3 stringi_1.5.3 stringr_1.4.0
tinytex_0.29 tools_4.0.3 utils_4.0.3 xfun_0.20 yaml_2.2.1
编辑:
我不确定这是否会有所帮助,但我想转换为 pdf 的 HW3.Rmd
文件如下所示:
---
title: "Homework 3"
subtitle: "due Feb 2,2021"
output:
pdf_document: default
---
```{r}
1 + 1
```
当我将此文件保存在 C:/Users/jungl/DropBox/GitHub/blog2020/static/Drexel_2021/HW3.Rmd
中的文件夹中时(这里 C:/Users/jungl/DropBox/GitHub/blog2020
是包含 blogdown 创建的所有文件夹/文件的根文件夹),“编织”按钮意外地调用,{ {1}}。但是,当我在文件夹中复制与 rmarkdown::render_site(...)
相同的 HW3.Rmd
时,“Knit”按钮按预期工作并调用 C:/Users/jungl/DropBox/test/HW3.Rmd
。所以看起来RStudio的“编织”按钮以某种方式自动确定它是否应该根据工作中的Rmd文件是否位于根文件夹的(子)文件夹中调用rmarkdown::render(...)
或rmarkdown::render_site(...)
保存 blogdown 生成的文件夹/文件。
编辑:
Github 存储库位于 rmarkdown::render(...)
,我刚刚检查了相同的问题是否仍然存在。我要转换为 PDF 的 https://github.com/junglee0713/blog2020
文件位于 HW3.Rmd
另一个编辑:安装 blogdown 的开发版本似乎解决了问题(下面的输出,注意它仍然调用 https://github.com/junglee0713/blog2020/tree/master/static/Drexel_2021
),但还有另一个问题。它将同一目录中的其他 Rmd 文件(例如 rmarkdown::render_site(...)
和 HW1.Rmd
)呈现为相应的 PDF 文件。
HW2.Rmd
因此,每次我将 ==> rmarkdown::render_site('C:/Users/jungl/DropBox/GitHub/blog2020/static/Drexel_2021/HW3.Rmd',encoding = 'UTF-8');
|.................. | 25%
ordinary text without R code
|................................... | 50%
label: setup (with options)
List of 1
$ include: logi FALSE
processing file: HW3.Rmd
|.................................................... | 75%
ordinary text without R code
|......................................................................| 100%
label: unnamed-chunk-1 (with options)
List of 1
$ eval: symbol F
"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS HW3.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output HW3.tex --lua-filter "C:\Users\jungl\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\pagebreak.lua" --lua-filter "C:\Users\jungl\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\latex-div.lua" --self-contained --highlight-style tango --pdf-engine pdflatex --variable graphics --variable "geometry:margin=1in"
output file: HW3.knit.md
Output created: HW3.pdf
`stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`.
渲染为 PDF 时,我也会收到 HW3.Rmd
和 HW1.pdf
的未经请求的更新(如您所见,我在 {{ 中没有任何 ggplot 图1}} 并且输出警告关于使用 binwidth 选择更好的值。HW2.pdf
中确实包含 HW3.Rmd
)。对我来说更有趣的是,在 HW2.Rmd
、geom_histogram()
和 HW1.Rmd
所在的文件夹中,还有其他我转换为 HTML 的 Rmd 文件(比如 HW2.Rmd
、{ {1}} 和 HW3.Rmd
-- 它们是 xaringan 幻灯片)并且它们不会受到编织的影响。
解决方法
当您单击“编织”按钮时,blogdown 确实先调用 rmarkdown::render_site()
,但此函数 actually calls rmarkdown::render()
eventually。
如果当您单击 Knit 按钮时它没有将您的 Rmd 文件编译为 PDF,请确保您使用的是最新版本的 blogdown,因为这听起来像是我已修复的错误几个月前 (when in doubt,try to update packages)。
如果你安装了blogdown的当前开发版本(安装后重启R):
install.packages('blogdown',repos = c(
rstudio = 'https://rstudio.r-universe.dev',CRAN = 'https://cloud.r-project.org'
))
当您单击编织按钮时,您将在 R Markdown 选项卡中看到详细的编织日志: