Pubmed API 返回的结果比 Web 界面少

问题描述

我正在尝试使用他们的 API 通过 R 访问 Pubmed 结果,但与使用 Web 界面时相同的查询获得的结果相比,我始终获得更少的结果。通过挖掘输出,我注意到问题在于两种访问方法间的不同查询转换。

我使用的是 rentrez 包,但我得到的结果与其他相关的 rpackage 也是一样的,所以我猜这与 API 本身有关。

这是重现结果的代码

install.packages('rentrez')

rentrez::entrez_search(db="pubmed",term = '((model OR models OR modeling OR network OR networks) AND (dissemination OR transmission OR spread OR diffusion) AND (nosocomial OR hospital OR "long-term-care" OR "long term care" OR "longterm care" OR "long-term care" OR "hospital acquired" OR "healtcare associated") AND (infection OR resistance OR resistant)) AND (2010[PDAT]:2020[PDAT])')$count

[1] 7157

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ 的相同查询返回 9263 个结果。

解决方法

不确定您现在是否还需要它。以防万一其他人有同样的问题。 我遇到了和你一样的问题,我从 GitHub 问题中发现了一些可能有用的东西。 似乎 API 服务需要更新以匹配新的 Web 服务,但现在已经一年了,官方仍然没有发布任何有希望的公告。 easyPubMed 作者提供了另一种选择。希望这就是您要找的。​​p>

easyPubMed Issue