roiManager：如何根据具有用户定义级别的变量定义颜色？ ImageJ 宏

问题描述

我目前正在研究 ImageJ 宏，以帮助我分析从水下海洋栖息地拍摄的样方照片。

简而言之，到目前为止，我已经设法创建了一个宏，该宏将图像划分为平方选区，根据我在宏中定义的行和列的数量形成一个网格。然后，对于每个选择（网格单元格），要求用户输入定义他所看到的内容的类别（例如沙子、贝壳、藻类）。这些类别以前没有定义，所以我无法知道会有多少。此外，图片之间的类别可能会发生变化。我想做的是根据其类别为每个选择填充一种颜色。例如，将所有归类为“藻类”的选项填充为绿色。

到目前为止，我所想到的并不是在宏中定义类别，而是打开一个对话框，要求用户为每个类别分配一个数字（因此是一个组），但这意味着用户还需要记住所有组/类别组合..

编辑：当为每个选择保存类别时，我设法创建了一个数组。但是，如果多个选择具有相同的类别（我知道会发生），则意味着我的数组充满了重复项。使用这个数组，是否可以将 group=1 归为沙子，将 group=2 归为贝壳，将 group=3 归为藻类？

EDIT2：我在网上找到了这个答案 https://forum.image.sc/t/random-color-generator/10506/4，考虑到一些适合我的问题的更改，它可能会有效。我会尝试相应地更新这篇文章。 --> 此答案中提到的代码允许我随机填充每个单元格，但它会将重复项视为不同的值（例如：按“藻类”分类的两个单元格将随机分配两种不同的颜色）。

我对创建 imageJ 宏完全陌生，但到目前为止，宏记录器以及在线找到的不同类型的文档都非常有用。但是，对于此组/类别问题的一些额外帮助将不胜感激！我什至不确定我正在尝试做的事情是否真的可行..

我可以研究的任何建议或功能都会有很大帮助！

以下是我目前所做的：

//Grid creation 
waitForUser("Please draw the upper left corner inside the quadrat. Press ok when finished");
setTool("point");
getSelectionCoordinates(xPoints,yPoints);
x = xPoints[0];
y = yPoints[0];
showMessage("Got coordinates ("+x+","+y+")");   

waitForUser("Please draw the bottom right corner inside the quadrat. Press ok when finished");
setTool("point");
getSelectionCoordinates(xPoints,yPoints);
x2 = xPoints[0];
y2 = yPoints[0];
showMessage("Got coordinates ("+x2+","+y2+")"); 

numRow = 2; //how many rows
numCol = 2; //how many columns
width = (x2-x)/numRow; //the width of the cell (pixel) 
height = (y2-y)/numCol; //the height of the cell (pixel)
spacing = 0; //spacing between the cells

//Will create as many selection as numRow*numCol add them to the ROI Manager
for (g = 0; g < numRow; g++) {
    for (j = 0; j < numCol; j++) {
        xOffset = j * (width + spacing);
        yOffset = g * (height + spacing);
        makeRectangle(x + xOffset,y + yOffset,width,height);
        roiManager("Add");
        run("Labels...","font=18 show draw");
        run("Add Selection...");
        run("Overlay Options...","stroke=yellow width=3 fill=none show"); 
    }
}
roiManager("Show All with labels");

setoption("ExpandableArrays",true);

catArray=newArray;

//For each cell,enter a category
for(h=0;h<roiManager("Count");h++){
    roiManager("select",h);
    run("Labels...","font=18 show");
        
    //Enter the category:
    Dialog.create("Observations");
    Dialog.addMessage("Please enter the name of the category:");
    Dialog.addString("Category:","Please enter a category");
    Dialog.show();
    category=Dialog.getString();

    catArray[h]=category;
    
    for(k=0;k<catArray.length;k++){
        setForegroungColor(255*random,255*random,255*random);
        run("Fill");
    }

} 
Array.print(catArray);

谢谢！

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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