问题描述
我正在创建一个读取整个文件夹的函数,创建一个 Dask 数据帧,然后处理该数据帧的分区并对结果求和,如下所示:
import dask.dataframe as dd
from dask import delayed,compute
def partitions_func(folder):
df = dd.read_csv(f'{folder}/*.csv')
partial_results = []
for partition in df.partitions:
partial = another_function(partition)
partial_results.append(partial)
total = delayed(sum)(partial_results)
return total
在 partitions_func
(another_function
) 中调用的函数也被延迟了。
@delayed
def another_function(partition):
# Partition processing
return result
我检查过,处理过程中创建的变量都很小,所以它们应该不会引起任何问题。分区可以很大,但不能大于可用 RAM。
当我执行 partitions_func(folder)
时,进程被杀死。起初,我认为问题与有两个 delayed
有关,一个在 another_function
上,一个在 delayed(sum)
上。
从 delayed
中移除 another_function
装饰器会导致问题,因为参数是 Dask 数据帧,您无法执行 tolist()
之类的操作。我尝试从 delayed
中删除 sum
,因为我认为这可能是并行化和可用资源的问题,但该进程也会被终止。
但是,我知道有 5 个分区。如果我从 total = delayed(sum)(partial_results)
中删除语句 partitions_func
并改为“手动”计算总和,则一切都按预期进行:
total = partial_results[0].compute() + partial_results[1].compute() + partial_results[2].compute() \
+ partial_results[3].compute() + partial_results[4].compute()
谢谢!
解决方法
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