如何使用 basename 并循环剪切

编程问答 2022-05-26

问题描述

我在运行 basename 时遇到了麻烦，当我将它们放入循环中时，我将它们剪切在一起以仅获取文件名的一部分（这是我的变量）。

我的代码是这样的：

for fq in ${output_folder}/bam/*.bam
do
base=$(basename "$fq" | cut -f 1-4 -d '_')
bamCoverage \
-b $fq \
-o ${output_folder}/bgwg/${base}.bw \
done

如果我只使用 base=$(basename "$fq") 一切都很好，但是如果我添加 cut 选项以仅使用基本名称的第一部分，程序将无法写入最终文件。好像是在写和剪文件。

我做错了什么？

谢谢 弗朗西斯卡

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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basenamebasenamecutloops