问题描述
在 R 中:我正在进行部分 RDA,使用前向选择程序来确定对鞘翅目群落最重要的解释变量。
但是如何在使用函数 ordiR2step 时不仅获得调整后的 R2 值,而且获得所有测试变量的 p 值?
为什么函数 ordiR2step 比 ordistep 快这么多??
解决方法
我首先回答最后一个问题:ordiR2step
比 ordistep
快得多,因为它没有估计所有 p 值。
p 值是通过置换测试找到的,并且对所有变量运行这些测试需要时间。
没有办法在 ordiR2step
中获得所有所谓的 p 值,因为该方法不使用这些值,如引用的源论文中所述(Blanchet 等人, 2008 在帮助页面)和帮助页面。这就是该方法被称为 ordi
R2step
的原因:它主要使用 R2 而不是 p-值。如果您想获得所有 p 值,您必须使用一种为评估这些值而编写的方法,即 ordistep
。