带有 invalidateLater() 的简单 Shiny 应用程序错误地删除了持久的后台进程

问题描述

我正在尝试编写一个最小的 Shiny 应用程序，它维护一个持久的外部后台进程。出于全尺寸用例的特定原因，我在文本文件中跟踪 PID，而不是仅使用 processx 句柄。当我启动应用程序时，它看起来像这样：

当我按下“开始”按钮时，应用程序会创建一个后台进程并将 PID 记录在一个文本文件中。带有 invalidateLater() 的响应式上下文会重复读取文本文件并显示 PID 和状态。

该进程应该一直运行，直到我单击“停止”。但在初始化后不到一秒钟，该进程自行退出。

如果我删除 invalidateLater()，进程会继续运行。或者，如果我使用 processx 句柄而不是 ps 和文本文件，应用程序也能工作，但这对于我的用例来说还不够。

应用代码

library(callr)
library(ps)
library(shiny)
library(tools)

ui <- fluidPage(
  actionButton("start","start"),actionButton("stop","stop"),textoutput("status")
)

server <- function(input,output,session) {
  file <- tempfile()
  observeEvent(input$start,{
    px <- r_bg(function() Sys.sleep(Inf))
    writeLines(as.character(px$get_pid()),file)
  })
  observeEvent(input$stop,{
    pid <- as.integer(readLines(file))
    if (pid %in% ps_pids()) {
      ps_kill(ps_handle(pid))
    }
  })
  output$status <- renderText({
    invalidateLater(100)
    if (file.exists(file)) {
      pid <- as.integer(readLines(file))
      paste(ifelse(pid %in% ps_pids(),"running","stopped"),pid)
    }
  })
}

shinyApp(ui = ui,server = server)

会话信息

R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)
Running under: macOS Catalina 10.15.7

Matrix products: default
BLAS:   /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] tools     stats     graphics  Grdevices utils     datasets  methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] shiny_1.6.0 ps_1.5.0    callr_3.5.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.6        magrittr_2.0.1    xtable_1.8-4      R6_2.5.0         
 [5] rlang_0.4.10      fastmap_1.1.0     jquerylib_0.1.3   htmltools_0.5.1.1
 [9] ellipsis_0.3.1    yaml_2.2.1        digest_0.6.27     lifecycle_1.0.0  
[13] processx_3.4.5    later_1.1.0.1     sass_0.3.1        promises_1.2.0.1 
[17] rsconnect_0.8.16  cachem_1.0.4      mime_0.10         compiler_4.0.3   
[21] bslib_0.2.4       jsonlite_1.7.2    httpuv_1.5.5

编辑：垃圾收集

这是因为垃圾收集的 processx 句柄。我可以用 2 个 R 会话来证明这一点。会话 1 创建一个后台进程。

px <- r_bg(function() Sys.sleep(Inf))
px$get_pid()
#> [1] 8252

会话 2 循环检查从会话 1 产生的后台进程。

library(ps)
while(TRUE) {
  print(8252 %in% ps_pids())
  Sys.sleep(1)
}

会话 2 开始时每秒打印 TRUE。但是当我在会话 1 中调用 rm(px); gc() 时，会话 2 打印 FALSE。

我现在看到垃圾回收的终止是 processx: https://github.com/r-lib/processx#features 的一个故意特性。我想在大多数情况下都是合理的。

解决方法

如果我在 cleanup 中将 TRUE 设置为 callr::r_bg()，该过程会继续进行。问题解决了。

callr processx r r shiny