Neuroimage MRI扫描CNN模型制备

问题描述

我想知道一些事情来消除我的困惑。我想处理来自 ADNI 数据库的医学神经影像 MRI 影像扫描数据集。

每个阿尔茨海病 (AD) MRI 图像扫描都有多个切片。 我是否必须将每个图像扫描切片分开并将每个切片标记为 AD 或将所有图像扫描切片组合为一个图像扫描并标记以进行分类

大多数医学神经影像DICOM、NfINT、NII等,格式。对于CNN网络模型,是否必须将它们转换为png或jpg格式或将其保留为NfNIT或nii格式?

我已经阅读了几篇关于阿尔茨海病神经影像学的现有论文,但没有找到上述问题的答案。甚至我也给研究论文作者发了一封电子邮件作为回复;我知道他们对此无能为力,因为他们很忙,并为此表示诚挚的歉意。

如果有人能解答我的困惑和想法,那将非常有帮助。 谢谢。

解决方法

您可以使用 NIfTI 进行训练,例如使用 TorchIO。无需分离每个切片,您可以按原样使用 3D 图像。

您可以在 documentation 中找到一些示例。

免责声明:我是 TorchIO 的主要开发者。