问题描述
我的程序,对于使用 DCMTK 3.6.4-2 的 Ubuntu 20 系统,读取 dicom 文件(系列)并从相应标签获取比例斜率,首先测试它们是否存在:
tmpfile.loadFile ( filename );
tmpdata = tmpfile.getDataset();
tmpdata -> findAndGetoFString ( DCM_RescaleSlope,tmpstring );
if ( !tmpstring.empty() ) {
mydcm.scl_slope = static_cast <float> ( stof ( std::string ( tmpstring.c_str() ) ) );
tmpdata -> findAndGetoFString ( DCM_RescaleIntercept,tmpstring );
mydcm.scl_inter = static_cast <float> ( stof ( std::string ( tmpstring.c_str() ) ) );
} else {
tmpdata -> findAndGetoFString ( DCM_RealWorldValueSlope,tmpstring );
mydcm.scl_slope = static_cast <float> ( stof ( std::string ( tmpstring.c_str() ) ) );
tmpdata -> findAndGetoFString ( DCM_RealWorldValueIntercept,tmpstring );
mydcm.scl_inter = static_cast <float> ( stof ( std::string ( tmpstring.c_str() ) ) );
}
在我使用的文件中,dcmdump 不会为 DCM_RescaleSlope
标签返回任何内容,但会为 DCM_RealWorldValueSlope
标签返回:
dcmdump filename | grep RealWorld
(0040,9096) SQ (Sequence with undefined length #=1) # u/l,1 RealWorldValueMappingSequence
(0040,9224) FD 0 # 8,1 RealWorldValueIntercept
(0040,9225) FD 4.1318681318681323 # 8,1 RealWorldValueSlope
当我使用
std::cout << getItemString ( tmpdata,DCM_RescaleSlope ) << std::endl;
std::cout << getItemString ( tmpdata,DCM_RealWorldValueSlope ) << std::endl;
std::cout << getItemString ( tmpdata,DCM_Modality ) << std::endl;
(其中 getItemString
为方便起见是一个函数)并使用调试器查看第二行中发生的情况,然后:
- 标签转换为
g = 64
,e = 37413
- 行
OFStatus s = theCondition.theStatus;
设置为 false (这就是所有的,除了theText = "Tag not found"
)
我不明白,因为 (i) 标签的值是程序知道的——否则它不会编译,(ii) 标签在图像中,如 dcmdump
和(iii) 其他标签处理正常:DCM_Modality
打印为 MR
。
是我做错了什么,还是这些特殊标签需要特殊处理?
编辑
我尝试了评论中的一个建议:在测试中使用 findAndGetFloat64
而不是 findAndGetoFString
double tmpdbl;
tmpdata -> findAndGetFloat64 ( DCM_RescaleSlope,tmpdbl );
std::cout << "A" << tmpdbl << std::endl;
tmpdata -> findAndGetFloat64 ( DCM_RealWorldValueSlope,tmpdbl );
std::cout << "B" << tmpdbl << std::endl;
tmpdata -> findAndGetFloat64 ( DCM_AcquisitionDuration,tmpdbl );
std::cout << "C" << tmpdbl << std::endl;
导致
A0
B0
C297.6
并且在读取 theStatus
行期间 B
中的错误仍然相同:theText = "Tag not found"
(我一直在使用字符串,因为到目前为止大多数双值标签都是 DS
,感谢您让我意识到其中的区别!)
解决方法
您要查找的标签位于序列 (RealWorldValueMappingSequence
) 内。要获得标签,您首先必须获得序列,如下所示:
DcmSequenceOfItems* sequence;
OFResult result = tmpData->findAndGetSequence(DCM_RealWorldValueMappingSequence,sequence);
if (result.good() && sequence && !sequence->isEmpty())
{
DcmItem* item = sequence->getItem(0); // you may have to iterate over the items instead
double value;
result = item->findAndGetFloat64(DCM_RealWorldValueSlope,value);
...
}
请注意,这是我的头脑,所以它可能不准确,但这基本上是获取序列项中的标签所需要做的。默认情况下,所有 findAndGet...
方法仅适用于当前项目,它可能是根数据集,但也可能是序列项目 - 您必须在 DICOM 标准中检查实际在哪里找到标签。
更新:
写完之后,我才意识到我忘记了 searchIntoSub
参数,所以这样做可能就足够了:
result = tmpData->findAndGetFloat64(DCM_RealWorldValueSlope,value,OFTrue);
其中 searchIntoSub=OfTrue
表示,也搜索包含的序列。
无论如何,我保留上述内容,因为如果在特定序列中搜索标签,其他人也可能需要它。
附注:
如果您使用此参数,您使用 findAndGetOFString
的第一种方法也应该有效。这在您的情况下没有意义,因为您需要实际的双精度值,但如果您只需要标记值的字符串表示形式,则可以使用它。来自 findAndGetOFString
的文档:
适用于以下 VR:AE、AS、AT、CS、DA、DS、DT、FL、FD、IS、LO、LT、OB、OD、OF、OL、OV、OW、PN、SH、SL,SS,ST,SV,TM,UC,UI,UL,UR,US,UT,UV