基因组组装重叠图

问题描述

我正在尝试制作一种算法来解决基因组组装问题。这是我的步骤：

1. 构建重叠图：通过最长的重叠读取连接读取。
2. 使用贪心算法在图中找到哈密顿路径。
3. 根据路径的顺序组装读取。

示例： [“AAC”、“ACG”、“GAA”、“GTT”、“TCG”]

图表：

所以正确答案应该是“AACGTTCG”。 但是在寻找哈密顿路径的过程中，顶点“ACG”有一个紧点。 “GAA”和“GTT”的边都是1。在这种情况下，没有办法通过选择重叠长度最长的边来选择合适的边。我应该怎么做才能解决这个问题？

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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