Seurat 元数据的特征图

问题描述

假设我有一个名为 seur 的 Seurat 对象，其元数据包括一个名为“count”（双精度列表）的列，该列显示某个单元格出现的次数。我想使用 FeaturePlot 工具在我的 UMAP 上绘制计数，以便我可以通过颜色渐变查看高计数的位置。

然而，当我这样做时：

FeaturePlot(seur,features = "count")

我收到错误：

count.Error in if (unique.feature.exp == 0) { : 
 missing value where TRUE/FALSE needed

如何解决此错误和/或正确使用 FeaturePlot？

解决方法

它应该可以工作，检查您有 Seurat 3 还是 Seurat 4，我正在使用下面的 Seurat_3.2.2：

library(Seurat)
seur = pbmc_small
eur$count = rpois(ncol(seur),5)
FeaturePlot(seur,features="count")