关于ape包提供的parafit函数的问题

问题描述

library("ape")

data(gopher.D)

data(lice.D)

data(HP.links)

res <- parafit(gopher.D,lice.D,HP.links,nperm=99,test.links=TRUE)

文件gopher.D的colnames是V1-V15,文件lice.D的colnames是V1-V17,但是HP.links中指明了gophers和lice的关联,包含了gophers或lice的具体名称。 我想知道V1-V15是否代表HP.links文件中地鼠名称的顺序,V1-V17代表虱子名称的顺序?或者它们只是地鼠/虱子名称随机顺序?

解决方法

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