在循环中使用“用变量设置猫”

问题描述

我有这个命令：

set k2p = `cat mrtm1/k2prime.dat` mri_glmfit --y gtm.nii.gz --mrtm2 km.ref.tac.dat time.dat $k2p --o mrtm2 --no-est-fwhm --nii.gz

我把它放在一个带有变量的 for 循环中：

export time=('4')

for i in ${time[*]}; do

    set k2p = 'cat $PATH/mrtm1_${i}/k2prime.dat' 

    mri_glmfit --y $PATH/gtm.nii.gz --mrtm2 $PATH/km.ref.tac${i}.dat $PATH/tmin${i}.dat $k2p --o $PATH/mrtm2_${i} --no-est-fwhm --nii.gz

done

fi
done

我试过了：

导出 k2p 变量

export k2p=$KM_PARENT_DIR/$OUTPUT/mrtm1_${i}/k2prime.dat

在命令中定义路径

export time=('4')

for i in ${time[*]}; do

    set k2p = 'cat $PATH/mrtm1_${i}/k2prime.dat' 

    mri_glmfit --y $PATH/gtm.nii.gz --mrtm2 $PATH/km.ref.tac${i}.dat $PATH/tmin${i}.dat $PATH/mrtm1_${i}/k2prime.dat --o $PATH/mrtm2_${i} --no-est-fwhm --nii.gz

done

fi
done

但是当我尝试运行 k2p 变量时，它不断出现错误。看来命令真的要我用set ...cat，但是cat命令并没有读取我设置的变量。

非常感谢任何帮助，我一直在努力解决这个问题

解决方法

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