问题描述
echo "accession\taccession.version\ttaxid\tgi" > reference_proteomes.taxid_map
zcat */*/*.idmapping.gz | grep "NCBI_TaxID" | awk '{print $1 "\t" $1 "\t" $3 "\t" 0}' >> reference_proteomes.taxid_map
我使用了 echo "accession\taccession.version\ttaxid\tgi" > reference_proteomes.taxid_map
和 zcat *.idmapping.gz | grep "NCBI_TaxID" | awk '{print $1 "\t" $1 "\t" $3 "\t" 0}' >> reference_proteomes.taxid_map
但我收到消息说参数列表太长:/usr/bin/zcat: Argument list too long
所以我在这方面尝试过 xargs:find /Volumes/My\ Passport\ for\ Mac/uniprot | xargs zcat *.idmapping.gz | grep "NCBI_TaxID" | awk '{print $1 "\t" $1 "\t" $3 "\t" 0}' >> reference_proteomes.taxid_map
但仍然收到长列表参数消息-bash: /usr/bin/xargs: Argument list too long
,有什么建议吗?
解决方法
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