问题描述
这是将我的 OTU 表、元数据、分类法和树作为一个对象导入 R 后当前使用的代码。我的问题在最后一行,我不断收到错误“dimnames(x)
physeq = phyloseq(OTU,TAX,Meta,phy_tree)
library(phyloseq)
tps = transform_sample_counts(physeq,function(x) x / sum(x) )
ftps = filter_taxa(physeq,function(x) {sum(x >0)>1},TRUE)
psfirm = subset_taxa(physeq,Phylum==“Firmicutes”)
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!
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