后验预测分布 RJags

问题描述

我拟合了以下模型,其中 Y 和 var1,...,vark 是已知变量:

Y ~ 二项式(P,试验)

trials ~ Uniform(0,1e3)

logit(P) = b_1 + b_2*var1 + ... + b_k*vark

b_1,bk ~ 正常(mean=0,sd=100)

BUGS的代码是:

model
{
    for (k in 1:4) {
        b[k] ~ dnorm(0,1E-04)
    }
    for (i in 1:60) {
        Y[i] ~ dbin(P[i],trials[i])
        trials[i] ~ dunif(0,1E3)
        logit(P[i]) <- (b[1] + b[2] * var1[i] + b[3] * var2[i] + b[4] * var3[i])
    }
}

我的目标是使用逻辑回归系数的后验分布(即 b_1、...、b_4)来预测不同数据集上的 P(var1、...、var3 的新值)。为此,我需要获得预测后验分布 (PPD),但我一直无法弄清楚如何做到这一点。 对于 RJgas,是否有类似于 rstanarm::posterior_predict() 的命令?如果没有,有谁知道在这种情况下如何获得 PPD?

解决方法

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