Networkx不在有向图中绘制箭头

问题描述

我有一个 5 节点的有向网络，我想使用 networkx 以图形方式表示。节点应该以这种方式连接：

• 每个节点都用虚线连接
• 从文件中读取活动连接并用黑色实线箭头表示
• 与运行代码的节点（在本例中为节点 1）之间的活动连接应为红色。

代码做了我想要的，但出于某种原因，即使我在想要制作红色边缘时指定了 arrow=True，箭头也没有出现。出于某种原因，它似乎忽略了我在 edge_color 之后指定的每个选项。

我注意到，当我在所有节点之间绘制边时，如果我不指定 arrows=False，它会忽略 style='dashed',alpha=0.5 并只绘制一条灰色实线。这与问题有关系吗？

这是我的代码，有问题的部分用注释注释：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

class Graph(nx.DiGraph):
    def __init__(self,*args,**kwargs):
        self.nodeNum = 1
        self.pos = {'1': (0,10),'2': (10,3),'3': (6,-8),'4': (-6,'5': (-10,3)}
        self.allConns = []
        for i in range(5):
            for j in range(i,5):
                self.allConns.append((str(i+1),str(j+1)))
        super().__init__(*args,**kwargs)

    def read_connections(self):
        filename = 'PATH/TO/FILE'
        with open(filename) as f:
            self.connList = []
            self.nodeConns = []
            for line in f:
                if line[-2] == '1':
                    self.connList.append((str(line[0]),str(line[1])))
                    if line[0] == self.nodeNum or line[1] == self.nodeNum:
                        self.nodeConns.append((str(line[0]),str(line[1])))
                    else:
                        pass
                else:
                    pass

    def generate_graph(self):
        self.read_connections()
        self.add_nodes_from(self.pos.keys())
        self.add_edges_from(self.connList)
        

    def draw_graph(self,fig=None,ax=None,show=False):
        if fig == None:
            fig = plt.figure()
        if ax == None:
            ax = fig.add_subplot(111)
        ax.axis('off')
        options = {'node_color': 'cyan','node_size': 1500,'width': 2,'arrowstyle': '-|>','arrowsize': 14,'font_size': 20
                   }
        
        # This works,but if I do not specify arrows=False it draws solid lines with no transparency
        nx.draw_networkx_edges(self,self.pos,ax=ax,edgelist=self.allConns,edge_color='grey',style='dashed',alpha=0.5,arrows=False)  

        # This is the main part which works. It connects the nodes from the file with black arrows
        nx.draw_networkx(self,arrows=True,**options)

        # This is the part that gives me problems. It seems to ignore every option after edge_color
        nx.draw_networkx_edges(self,edgelist=self.nodeConns,edge_color='r',style='solid',alpha=1,width=3,arrowsize=14,arrowstyle='-|>')
        nx.draw_networkx_nodes(self,nodelist=[self.nodeNum],node_color='r',node_size=1500)

        fig.tight_layout()
        if show == True:
            fig.show()

if __name__ == '__main__':
    graph = Graph()
    graph.generate_graph()
    graph.draw_graph(show=True)

以及结果示例。请注意红色边缘如何没有箭头。

解决方法

我很确定箭头已绘制，但根本不可见，因为之后您将绘制具有更高节点大小的节点作为默认值。将 node_size 给 draw_networkx_edges 应该可以解决您的问题

nx.draw_networkx_edges(self,self.pos,ax=ax,edgelist=self.nodeConns,edge_color='r',style='solid',alpha=1,arrows=True,width=3,arrowsize=14,arrowstyle='-|>',node_size=1500,)

draw_networkx_edges 的文档还包含以下注释

对于有向图，箭头绘制在头端。 (...) 确保包含 node_size 作为关键字参数；箭头是根据节点的大小绘制的