predict.coxph 在类型为“风险”时有效,但在类型为“预期”或“生存”时无效

问题描述

我有一个多类 coxph 模型,我试图用它来预测结果(R - survival 包,v 3.1-12)

最初,我想将模型应用回整个训练集,以向业务用户展示它正在做什么(在应用于新案例之前)。

例如

df <- data.frame (ID  = c(1,1,2,3,3),start = c(0,5,9,7,10,12),end   = c(4,8,12,6,14,11,14),fact = c('a','a','b','b'),status = c(0,2)
)

df$fact <- as.factor(df$fact)
df$status <- as.factor(df$status)

library(survival)

eg.coxph <- coxph(Surv(start,end,status) ~ 
                        fact,data = df,id = ID)

predict(eg.coxph,type = c('risk'))      # works
predict(eg.coxph,type = c('survival'))  # does not work

predict(eg.coxph,type = c('survival'),collapse = ID)  # does not work

我不清楚为什么会收到此错误

Error in predict.coxph(eg.coxph,type = c("survival")) : 
  Data is not the same size as it was in the original fit

当我尝试返回 type = 'expected' 或 type = 'survival' 值而不是 lp 或 risk 时?

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!

如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@)