问题描述
我在两个不同的平台上运行 R：
Windows 上的一个：
> version
_
platform x86_64-w64-mingw32
arch x86_64
os mingw32
system x86_64,mingw32
status
major 4
minor 0.2
year 2020
month 06
day 22
svn rev 78730
language R
version.string R version 4.0.2 (2020-06-22)
nickname Taking Off Again
Ubuntu/Linux 上的另一个：
> version
_
platform x86_64-pc-linux-gnu
arch x86_64
os linux-gnu
system x86_64,linux-gnu
status
major 4
minor 0.4
year 2021
month 02
day 15
svn rev 80002
language R
version.string R version 4.0.4 (2021-02-15)
nickname Lost Library Book
令我非常沮丧的是，我发现使用相同的 read.table 参数运行 skip 会在两个系统上返回不同的结果。
当我在 Windows 上运行以下命令 read.table("data2.txt",skip = 6,fill = F,sep = "\t") 时：
> read.table("data2.txt",sep = "\t")
V1 V2 V3 V4
1 NA Aerococcus 3 3
2 NA Enterobacter / Citrobacter 4 4
3 NA Enterococcus faecalis 3 3
4 NA Enterococcus faecium 4 4
5 NA Escherichia coli 35 35
6 NA Klebsiella 7 7
7 NA Morganella / Providencia / P. vulgaris 1 1
8 NA Proteus mirabilis 10 10
9 NA Pseudomonas aeruginosa 10 10
10 NA Serratia 2 2
11 NA Staphylococcus aureus 3 3
在 Linux 上运行相同的命令，我得到：
> read.table("data2.txt",sep = "\t")
V1 V2 V3 V4
1 NA Erreger-Gruppe / Intervall Gesamt 2019
2 NA Gesamt 82 82
3 NA Aerococcus 3 3
4 NA Enterobacter / Citrobacter 4 4
5 NA Enterococcus faecalis 3 3
6 NA Enterococcus faecium 4 4
7 NA Escherichia coli 35 35
8 NA Klebsiella 7 7
9 NA Morganella / Providencia / P. vulgaris 1 1
10 NA Proteus mirabilis 10 10
11 NA Pseudomonas aeruginosa 10 10
12 NA Serratia 2 2
13 NA Staphylococcus aureus 3 3
您可以从 dropbox 下载 data2.txt。
有没有办法让两个命令的行为保持一致？不幸的是，我不知道如何更正 read.table
谢谢。
解决方法
它包含奇怪的换行符。例如在 mg 中打开它：
如果我在第 3 行删除多余的回车符，并使用 skip=4 读取它，似乎没问题：
Linux：
> read.table("data2.txt",skip = 4,header=T,fill = F,sep = "\t")
X Erreger.Gruppe...Intervall Gesamt X2019
1 NA Gesamt 82 82
2 NA Aerococcus 3 3
3 NA Enterobacter / Citrobacter 4 4
4 NA Enterococcus faecalis 3 3
5 NA Enterococcus faecium 4 4
6 NA Escherichia coli 35 35
7 NA Klebsiella 7 7
8 NA Morganella / Providencia / P. vulgaris 1 1
9 NA Proteus mirabilis 10 10
10 NA Pseudomonas aeruginosa 10 10
11 NA Serratia 2 2
12 NA Staphylococcus aureus 3 3
窗口：
如果你再深入一步，逐个字节地查看文件，你会发现它确实连续有两个回车符（0D）（它不应该有），而不是预期的序列 0D0A 作为换行符，因为 windows 喜欢它们）：
更好的方法
如果您使用 data.table::fread，无论回车错位如何，它似乎都能做正确的事情：
dim( data.table::fread("data2.txt") ) 在 linux 和 windows 上都给出 12 4。