问题描述
我们如何在 Bacillus 带注释的 .fna 文件中发现 INDEL 错误?有模板/例子吗?
我已经在 RAStk 中注释了一个 fasta 序列核苷酸,并且正在关注如何进一步管理它的论文。它提到插入/删除 (indels) 错误在 CLC Genomics Workbench 11 中得到纠正和调整,因为有足够的深度覆盖。我想应用 CLC 基因组学工作台来检查序列中的错误,但是如何识别什么是错误以及什么是无错误/或更正的文件,以帮助识别插入缺失序列是否已被修改。我们可以打开 fasta 文件并识别错误吗?
解决方法
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