使用 Holoviews + Datashader 处理大型网格数据

问题描述

我正在尝试以交互方式查看 (52608x11999) 网格数据作为图像。我想放大给定的特征并让 datashader + holoviews 重新渲染适当数量的点。我正在看这个教程：https://datashader.org/getting_started/Interactivity.html

下面是一些我无法开始工作的带有虚拟数据的代码：

import numpy as np
import pandas as pd
import xarray as xr
import holoviews as hv
import holoviews.operation.datashader as hd
import hvplot.xarray  # noqa

dates_ns = np.linspace(pd.Timestamp('2017-01-01').value,pd.Timestamp('2017-12-31').value,365)
dates = pd.to_datetime(dates_ns)

t = np.linspace(-10,10,500)
data = np.random.rand(365,500)

data_xr = xr.DataArray(data,dims=['dates','time'],coords={'dates':dates,'time':t})

img = hv.Image(data_xr)
hd.datashade(img)

我收到以下错误：

WARNING:param.dynamic_operation: Callable raised "AttributeError("'DataArray' object has no attribute '_file_obj'")".
Invoked as dynamic_operation(height=400,scale=1.0,width=400,x_range=None,y_range=None)

AttributeError: 'DataArray' object has no attribute '_file_obj'

谢谢！

解决方法

这个问题应该很容易通过谷歌搜索错误消息加上“Datashader”来回答，引导你到 https://github.com/holoviz/datashader/issues/990，但无论如何，答案是你需要 Datashader 0.12.1 或更高版本，如果你愿意使用 xarray 0.17 或更高版本。