创建一个从 `rdf:Bag` 中提取信息而不会丢失信息的 SPARQL 查询

问题描述

我对 RDF 还很陌生，但我需要构造一个 RDF 查询来从现有的 RDF 图中提取一些信息。实质上，我正在尝试清除 rdf:Bag 构造的现有 RDF 图。

例如，给定 RDF 图：

@prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#> .
@prefix bqbiol: <http://biomodels.net/biology-qualifiers/> .

<http://omex-library.org/NewOmex.omex/NewModel.xml#_1>
    bqbiol:is [
        rdf:_1 <http://identifiers.org/uniprot/P00742> ;
        a rdf:Bag
    ] .

我需要在不丢失信息的情况下从 rdf:Bag 中提取信息。因此，在这种情况下，生成的 rdf 图将是：

@prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#> .
@prefix bqbiol: <http://biomodels.net/biology-qualifiers/> .

<http://omex-library.org/NewOmex.omex/NewModel.xml#_1>
    bqbiol:is <http://identifiers.org/uniprot/P00742> ;

我的替代方法是在首先创建图形之前使用 libxml2 进行此更改，但似乎 sparql 在这里应该有用（如果我错了，请纠正我）。

有人可以帮我吗？到目前为止，我所想到的只是一个通用的“找到我的一切”sqarql 查询，又名

SELECT ?x ?y ?z 
WHERE {?x ?y ?z }

生产

x,y,z
_:r1r21532r1,http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#type,http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#Bag
_:r1r21532r1,http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#_1,http://identifiers.org/uniprot/P00742
http://omex-library.org/NewOmex.omex/NewModel.xml#_1,http://biomodels.net/biology-qualifiers/is,_:r1r21532r1

所以我生成的任何 sparql 查询都需要涉及特定的 r1r21532r1 空白节点。

编辑：有点进步。

spaqrl 查询

SELECT  ?s ?p1 ?p2
WHERE {
    ?s ?p1 [ ?p2 <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#Bag> ] . 
}

生产

| uri<http://omex-library.org/NewOmex.omex/NewModel.xml#_1> | uri<http://biomodels.net/biology-qualifiers/is> | uri<http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-Syntax-ns#type> |

哪个更近，但沿途会丢失一些信息。

解决方法

SELECT ?x (bqbiol:is AS ?y) ?z {
    ?x bqbiol:is [ a rdf:Bag ; !a ?z ] . 
}

或

SELECT  ?x ?y ?z {
    BIND (bqbiol:is AS ?y)
    ?x ?y [ a rdf:Bag ; !a ?z ] . 
}

在 Apache Jena 中或在 RDFS 蕴涵下：

SELECT ?x (bqbiol:is AS ?y) ?z {
    ?x bqbiol:is [ a rdf:Bag ; rdfs:member ?z ] . 
}

您也可以使用 CONSTRUCT 查询表单：

CONSTRUCT { ?x bqbiol:is ?z } {
    ?x bqbiol:is [ a rdf:Bag ; !a ?z ]
}