glmmTMB 'giveCsparse' 的每个模型中的警告

编程问答 2022-05-14

问题描述

我正在使用 glmmTMB 库在 R 降价文档中运行混合模型。我运行的任何模型，都会收到以下警告：

'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

然后，如果我在控制台中运行代码，则会收到以下警告：

Warning messages:
1: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0,0),i = integer(0),j = integer(0),:
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
2: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0,:
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you
3: In Matrix::sparseMatrix(dims = c(0,:
  'giveCsparse' has been deprecated; setting 'repr = "T"' for you

我的代码如下：

m1 <- glmmTMB(count~var1+var2+var3+(1|group),data = bd,family = "poisson")

我尝试使用 dependencies=TRUE 重新安装 TMB 和 glmmTMB，但该消息一直出现。显然它根本不会影响模型，但是无论我做什么测试或图表，我都会收到警告。有没有可能解决这个问题？或者我只是忽略它？

解决方法

这是无害的。您可以：

  1. 忽略它
  2. 使用 suppressWarnings()（可能会错过其他相关警告！）
  3. install the development version from GitHub，它在 this commit 中已修复。 （存储库中的二进制包现在也已更新。）
  4. 等待新版本的 glmmTMB 发布到 CRAN（希望在接下来的几周内......）

或者您可以降级您的 Matrix 版本到旧版本（使用 remotes::install_version() 或 snapshot 包）

glmmtmbrrwarnings