如果整个地面实况是黑色的,则医学图像分割

问题描述

我是深度学习的新手。我正在处理 CT 扫描医学图像。我想使用 UNet 架构来预测图像分割。我已经成功实施了 UNet,但是,我的预测完全是黑色的。我认为这是因为有图像,其对应的地面实况是黑色的(相当多的图像)。所以,我想这可能会导致问题。

如果整个蒙版为黑色,则表示图像中没有所需的对象。示例图像如下;

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以下是相应的基本事实

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我不知道如何处理这种情况。我应该删除所有的 (image,ground truth) 对吗? CT 图像是体积图像。因此,当我的模型预测新测试集中的分割时,它也应该检测其中没有所需对象的图像。如果有人指导我,我将不胜感激。

数据集:https://www.doc.ic.ac.uk/~rkarim/la_lv_framework/wall/index.html

解决方法

图像分割更像是pixel classification而不是图像分类。
因此,您不应该看“空白图像”/“对象图像”的比率,而应该看“空白像素”/“对象像素”的比率。我猜这个比例更倾向于“空白”像素。

这意味着您正在处理严重的 class imbalance

This answer 将焦点损失和在线硬负挖掘列为处理类不平衡的好方法。