rioxarray或xarray在重新投影并使用to_netcdf保存后将spatial_ref坐标转换为变量？

编程问答 2022-05-04

问题描述

我有一个“dataarray”，我正在尝试使用 rioxarray 重新投影它。但是，当我使用 xarray.to_netcdf 进行重新投影后，保存的文件是一个数据集，其中“spatial_ref”坐标转换为变量。我不确定这是 xarray 还是 rioxarray.reprojection 导致这种行为。以下是一些显示问题的代码：

import xarray as xr 
import rioxarray
from pyproj import CRS 

lst = xr.open_dataset("lst.nc") # File which carries the original CRS
luc = xr.open_Rasterio("luc.tif") # File with the desired projection system
file_to_reproject = xr.open_dataarray("myfile.nc") # File to reproject

cc_lst = CRS.from_cf(lst.crs.attrs) # Get the CRS 
cc_luc = luc.rio.crs

file_to_reproject = file_to_reproject.rio.write_crs(cc_lst) # write crs 
file_reprojected= file_to_reproject.rio.reproject(cc_luc) #reproject the file

print(file_reprojected)
<xarray.DataArray (season: 4,y: 4343,x: 4172)>
array([[[nan,nan,...,nan],[nan,nan]]])
Coordinates:
  * x            (x) float64 -3.382e+06 -3.381e+06 ... 4.817e+05 4.826e+05
  * y            (y) float64 5.361e+06 5.36e+06 ... 1.338e+06 1.337e+06
  * season       (season) object 'DJF' 'JJA' 'MAM' 'SON'
    spatial_ref  int64 0

# however after saving the file and reloading it I get a dataset where 
# spatial_ref turned into variable 
file_reprojected.to_netcdf("file_reprojected.nc")
ds= xr.open_dataset("file_reprojected.nc")

>>> print(ds)
<xarray.Dataset>
Dimensions:                        (season: 4,x: 4172,y: 4343)
Coordinates:
  * x                              (x) float64 -3.382e+06 ... 4.826e+05
  * y                              (y) float64 5.361e+06 5.36e+06 ... 1.337e+06
  * season                         (season) object 'DJF' 'JJA' 'MAM' 'SON'
Data variables:
    spatial_ref                    int64 ...
    __xarray_dataarray_variable__  (season,y,x) float64 ...

# Here is the content of spatial_ref
>>> print(ds["spatial_ref"])
<xarray.DataArray 'spatial_ref' ()>
array(0)
Attributes: (12/19)
    crs_wkt:                        PROJCS["unkNown",GEOGCS["unkNown",DATUM["...
    semi_major_axis:                6378137.0
    semi_minor_axis:                6356752.314140356
    inverse_flattening:             298.257222101
    reference_ellipsoid_name:       GRS 1980
    longitude_of_prime_meridian:    0.0
    ...                             ...

正如您在重新投影数据数组并保存后所看到的那样，文件变成了数据集，并将空间引用作为新变量。

我只对地理参考数据数组感兴趣。我该如何解决这个问题？

编辑 1

我认为它可能与此 (here) 问题有关

Edit2

我忘记在导入重新投影的文件时提到没有 crs：

ds= xr.open_dataset("file_reprojected.nc")
ds.rio.crs # Retruns nothing

解决方法

问题是我在使用 xarray.open_dataarray 时没有设置 decode_coords="all"。有了以下一切看起来没问题：

file_to_reproject = xr.open_dataarray("myfile.nc",decode_coords="all")
netcdfpythonpython-xarray